马皇后深知倔驴就要顺毛撸，就像当年的长孙皇后劝谏唐太宗一样。作为明朝开国文臣之首的宋濂，就是初中课本中《送东阳马生序》的作者，本来已经告老还乡，在家安心养老。但是他的孙子宋慎却被牵扯进胡惟庸案中，受其牵连，宋濂一家遭祸，宋濂本人按律当斩。为了说情，马皇后摆事实讲道理，宋濂为明朝宗室特别是太子普及文化有功，对老朱家有师恩，而且一个退休多年的老干部，一个退居二线后不再参与政治的老头子，本来就行将朽木，活不了多少年了，杀个老头子又没啥意义，说出去还不好听，杀他干吗？结果遭到朱元璋无情拒绝。于是，当天马皇后在为朱元璋准备的御膳中，只有素菜，没有酒肉，朱元璋对此大为不解，于是问马皇后这是何意，马皇后答道自己是在提前为宋先生做福事，搞得朱元璋很不愉快，一怒之下扔了筷子就走，连饭都不吃了。但是第二天，朱元璋还是改了对宋濂的处罚，免去死刑。
参军郭景祥守和州（今安徽和县），有人向朱元璋告发，说他的儿子试图谋杀他，以子谋父，别说是在古代，在现代都是大不孝，对于注重孝道的朱元璋来说绝对不能忍，于是当场就指示，郭景祥的这个儿子必须干掉，这个时候又是马皇后出面出来劝阻，但是马皇后没有直接说告发不实，知道此时此刻说了也没有用，朱元璋气头上不会信，而是先提醒朱元璋郭景祥就这么一个儿子，如果直接听信告发，贸然杀了他，郭家可就绝后了，弑父这么大的事皇上难道都不派人再查证一下，他杀他爹图啥，又不是家里有皇位，朱元璋想了想觉得有道理，于是就派人前往调查，果然发现告发不实。事后，朱元璋感谢马皇后，如果不是她的劝阻，可能就真错杀了郭景祥的儿子。